国家高新技术企业由科技部、财政部、税务总局组成的全国高新技术企业认定管理工作领导小组认定。
高新技术企业认定项目是国家科技部管理，下设省级科技委，市级科技局，企业需要申请高新技术企业认定，须准备高新技术企业认定材料，提交到县市级科技局高新科办公室，经科技局高新科审核并公示，公示期一般为5天左右，无疑义后方可制定，盖章，并颁发高新技术企业认定证书，证书有效期为3年。
3年内需要定期提交高新技术企业年报等有效数据，方可继续享受高新技术企业扶持与优惠政策。
企业也可拨打当地科技局电话，了解咨询高新技术企业认定条件等相关事宜，获得权威有效信息。
其主要职责为
(一)确定全国高新技术企业认定管理工作方向，审议高新技术企业认定管理工作报告;
(二)协调、解决认定及相关政策落实中的重大问题;
(三)裁决高新技术企业认定事项中的重大争议，监督、检查各地区认定工作;
(四)对高新技术企业认定工作出现重大问题的地区，提出整改意见。
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