关于农产品发票扣除率的问题

我公司从事餐饮行业，需要购进部分农产品，这部分农产品供应商提供的发票分为三类，一类供应商开具的是税务局代开的3%税率的增值税专用发票，第二类个体工商户开具的是税率为0的增值税普通发票，第三类供应商是大型超市，开具的是税率为免税的增值税普通发票。我想问一下：1、对于这三类供应商，我公司进项税该如何处理？2、我公司之前仅对3%税率的增值税专用发票按照11%（五一之后10%）进行加计扣除抵扣，是否正确？3、关于农产品的税法条款，既有13%税率的又有11%税率的（五一之后为12%和10%），怎样区分按照哪个税率扣除？谢谢